Грязелечение в России имеет глубокие народные корни: русские — культивировалось на побережье Белого и Баренцева морей, татарские — в Нижнем Поволжье; греческие — на Черноморском побережье; бурятские, тувинские, якутские — в Восточной Сибири. Донные отложения преимущественно соленых водоемов, бедные органическими веществами и обогащенные сульфидами железа и водорастворимыми солями, иногда называют «основным», или «собственно грязями». Именно такие грязи использовались в Древнем Египте, в греческих колониях Крыма и Черноморского побережья Кавказа, в Центральной Азии и Восточной Сибири, поморами Беломорья. Вначале ХIХ в. грязелечение стало ведущей процедурой курортного лечения. Первые грязелечебницы открылись в Тинаках и Одессе (1820). Почти одновременно грязелечение началось в Саках (1827), Старой Руссе (1839), позже — на Сергиевских Минеральных Водах, в Липецке (1871) и на Кавказских Минеральных Водах (1886), в Анапе (1900). В основном оно проводилось на южных грязевых станциях и только в летние месяцы, когда грязь можно было нагревать на солнце.

Грязелечение на Балтийском побережье известно с давних времен. Чудодейственными балдонскими грязями Рижского взморья излечивались раненые во времена сражений крестоносцев с местными племенами в XII в., прикладывая их к ранам, которые затягивались быстро и без нагноений. В 1793 г. кенигсбергский профессор медицины И.Д. Метцгер в одной из статей в «Прусском архиве» убеждал коллег в необходимости строительства курорта на Балтийском побережье в Раушене (Светлогорск) , где были минеральные источники и лечебные торфяные грязи.

Грязелечение на Северном курорте – так тогда называли курорт в Старой Руссе, - начали примеять в первой половине XIX в. Когда в 1828 г. сюда прибыл лейб-медик Императорского двора Раух, он обратил внимание, что местные жители купаются в какой-то грязи. Оказалось, они лечили в ней все свои болезни — золотуху, ломоту костей, язвы, краснуху. По указанию Николая I в Старой Руссе были устроены госпитали для солдат. Как писал в 1879 г. врач старорусского госпиталя К.А. Шенк «старорусские лечебные грязи ...не уступают никаким другим не только в России, но и вообще в Европе». В 1854 г. курорт передали гражданскому ведомству и на лечение стали приезжать самые высокопоставленные особы. На курорте, расположенном на пути из Петербурга в Москву, был построен Путевой дворец, где останавливались члены царской семьи. Сохранился рецепт грязелечения для светских красавиц: дамские талии затягивали в плотный корсет из лечебной старорусской грязи. Считалось, что грязь «поедает» жировые складки на боках.

Грязелечение на Кавказских Минеральных Водах начинает развиваться в конце XIX века. «Тамерлан принимал лечебные ванны и грел больную ногу волшебной грязью», – читаем мы в «Книге победы Шафардзина и Ядзи» о походе Тамерлана в 1395 г. на Северный Кавказ. Речь идет о сульфидных иловых грязях озера Тамбукан, в 1773 г., Тамбукан был описан И. Гюльденштедтом под названием «Тамби», что в переводе с древнетюркского означает «плохой, дурной запах». В 1872 г. Ф.Ф. Шмидт сделал первый химический анализ рапы Тамбуканского озера, а в 1886 г. грязь Тамбуканского озера стали применять для лечения на Кавминводах в виде «болтушек», т.е. определенное количество грязи разводилось в минеральной ванне. Для грязелечения в Пятигорске использовались Николаевские ванны, а в Железноводске - Островские ванны. В 1915 г. в Ессентуках возведена самая большая грязелечебница в Европе. Сегодня Ессентукская грязелечебница – это огромный лечебно-профилактический комплекс из четырех корпусов с грязехранилищем на 4650 тонн (построенное также в 1915 г.) и гидропатическим отделением с оригинальными душевыми кафедрами. Комплекс может одновременно принять 186 человек из 32 санаториев города.
Грязелечение в Крыму стало основой российской научной школы пелоидотерапии. В 1828 г. в Саках открылся официально на земские средства первый в мире грязевой курорт, а десять лет спустя - отделение Симферопольского военного госпиталя. В период Крымской войны (1853—1856 гг.) по предложению Н.И. Пирогова в Саках стали практиковать лечение грязями раненных в позвоночник и спинной мозг. В 1910 г. С.С. Налбандов и Н.Н. Бурденко организовали на курорте первую в России «народную лечебницу», где лечение проводилось бесплатно. Учитывая необходимость лечения последствий боевой травмы нервной системы, в 1915 г. в Саках было организовано неврологическое отделение. Профессор-курортолог С.С. Налбандов и академик Н.Н. Бурденко, основоположник нейрохирургии в России, разработали научные основы грязелечения. В Сакском санатории им. Н.Н. Бурденко были разработаны уникальные методы грязелечения больных с травматической болезнью спинного мозга. Первый санаторий для пациентов с ограниченной возможностью передвижения был открыт в 1947 г. на курорте Сергиевские Минеральные Воды, а на следующий год открылось специализированное спинальное отделение на Сакском курорте.